ประวัติสถานศึกษา

              โรงเรียนศึกษาพิเศษสุพรรณบุรี (เดิม) กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศจัดตั้งขึ้นเมื่อวันที่ ๑๗ มกราคม พ.ศ. ๒๕๓๘ โดยได้รับการผลักดันของฯพณฯ บรรหาร ศิลปอาชา สมาชิกสภาผู้แทนราษฎรจังหวัดสุพรรณบุรี ด้วยเล็งเห็นความสำคัญของการจัดการศึกษาให้ผู้ด้อยโอกาสทางด้านสติปัญญา ควรได้รับโอกาสทางการศึกษาอย่างทั่วถึง และเพิ่มมากขึ้น โดยกำหนดขอบเขตรับผิดชอบในพื้นที่จังหวัดเขตการศึกษาเขต ๕ และจังหวัดใกล้เคียง และให้จัดตั้งเป็นหน่วยงานหนึ่งของโครงการจัดตั้งศูนย์ราชการแห่งที่ ๒ ของจังหวัดสุพรรณบุรี บนเนื้อที่ ๒๖ ไร่ ๒ งาน ๒๗ ตารางวา และได้งบประมาณในการก่อสร้างอาคารเรียน หอพักนักเรียน โรงหุงต้ม บ้านพักครู โรงอาบน้ำนักเรียน จำนวน ๙ รายการ เป็นเงินก่อสร้างทั้งสิ้น ๑๕,๗๐๗,๔๐๐ บาท

              ในปีการศึกษา ๒๕๔๗ กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศเปลี่ยนชื่อให้โรงเรียนศึกษาพิเศษสุพรรณบุรีเป็นโรงเรียนสุพรรณบุรีปัญญานุกูล  จังหวัดสุพรรณบุรี  สังกัดสำนักบริหารงานการศึกษาพิเศษ สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน  กระทรวงศึกษาธิการ  รับนักเรียนที่มีความบกพร่องทางด้านสติปัญญาและออทิสติกในเขตจังหวัดสุพรรณบุรีและจังหวัดใกล้เคียง  ได้แก่  นครปฐม  กาญจนบุรี  ชัยนาท  สิงห์บุรี  อ่างทอง  พระนครศรีอยุธยา  ปทุมธานี  นนทบุรีและกรุงเทพมหานคร